Проекты

Краткое описание

События начала 2022 года выявили проблему - огромное количество специалистов-биоинформатиков являются сотрудниками иностранных компаний. Многим было предложено мигрировать из России. Это означает, что в нашей стране рынок специалистов-биоинформатиков снова остается без специалистов. Особенно актуально это для Калининградской области - эксклавного региона России.
В течение последних 10 лет биоинформатика пережила стремительный рост популярности и стала обязательной частью практически всех наук о живом. Причина этому — революционный прогресс методов и падение стоимости секвенирования ДНК.
Сейчас врачи используют геном человека как еще один образцов для анализа, который может дать довольно много всякой информации. Сегодня это называется «персонализированной медициной».
Направление в науках о человеке, которое направлено на сбор и анализ больших данных, называют биоинформатикой.
Технологии биоинформатики необходимы в биохимии, биофизике, экологии, фармакологии, сельском хозяйстве, генетике и других сферах. За почти 10 лет объем рынка биоинформатики вырос в 5,5 раз (около 500 млн.долл ежегодно).
По словам директора Института проблем передачи информации РАН Михаила Гельфанд, биоинформатика – это область, в которой действительно есть шанс сделать что-то безумно интересное. Просто потому что прогресс в науке — и технологический, и в понимании — происходит с невероятной скоростью… Мы очень сильно недорабатываем с данными, которые есть, не вынимаем оттуда все, что можно было бы использовать». И связано это прежде всего с тем, что много данных получить уже не проблема, а специалистов, способных с этими данными работать крайне мало.
В Калининградской области вузы осуществляют подготовку специалистов по наукам о человеке., в том числе по биоинформатике, однако среди студентов и молодых ученых в данной области существует потребность в развитии профессионального сообщества вне стен вуза, а также в более углубленном практическом обучении со специалистами-биоинформатиками-практиками. И с целью формирования у молодых исследователей, ученых, студентов и школьников дополнительных компетенций в области анализа больших био-данных будет осуществлен проект летняя научная школа для молодых ученых, аспирантов и студентов по биоинформатике.
Проект инициирован сообществом молодых ученых Балтийского федерального университета им.И.Канта и поддержан Ассоциацией учителей и преподавателей биологии региона.
Количество участников школы – не менее 30, количество открытых мероприятий по направлениям работы школы (открытых лекций, мастер-классов, полевых исследований) – не менее 2, количество преподавателей школы – специалистов в области биоинформатики, привлеченных к реализации проекта – не менее 3.
Срок реализации проекта – 01.07.2022 – 30.09.2022

Цель

1. Формирование профессионального сообщества молодых ученых-биоинформатиков, популяризация инженерного и IT-образования, развитие образовательной среды в Калининградской области

Задачи

1. популяризация биоинформатики как перспективного направления для получения образования и построения карьеры среди кемеровских студентов, школьников старших классов
2. развитие образовательных инициатив молодых ученых в Калининградской области - эксклавном регионе
3. организация работы научной школы

Обоснование социальной значимости

События начала 2022 года выявили проблему - огромное количество специалистов-биоинформатиков являются сотрудниками иностранных компаний. Многим было предложено мигрировать из России. Это означает, что в нашей стране рынок специалистов-биоинформатиков снова остается без специалистов. Особенно актуально это для Калининградской области - эксклавного региона России.
Развитие наук о человеке (биология, медицина) в XXI веке связано с анализом большого объема данных. Это не традиционный анализ медицинский данных, когда собираются истории болезни или производится анализ клинических испытаний, но что-то близкое.
Сейчас врачи используют геном человека как еще один образцов для анализа, который может дать довольно много всякой информации. Сегодня это называется «персонализированной медициной».
Направление в науках о человеке, которое направлено на сбор и анализ больших данных, называют биоинформатикой.
Предметом биоинформатики являются молекулярные процессы, исследования которых проводятся не in vitro, а in silico, т.е. не в пробирке, а при помощи компьютеров.
Технологии биоинформатики необходимы в биохимии, биофизике, экологии, фармакологии, сельском хозяйстве, генетике и других сферах. За почти 10 лет объем рынка биоинформатики вырос в 5,5 раз (около 500 млн.долл ежегодно).
Биоинформатика обладает огромным потенциалом. На международном рынке труда есть дефицит биоинформатиков, в них заинтересованы как фармакологические, так и IT-компании.
По словам директора Института проблем передачи информации РАН Михаила Гельфанд, биоинформатика – это область, в которой действительно есть шанс сделать что-то безумно интересное. Просто потому что прогресс в науке — и технологический, и в понимании — происходит с невероятной скоростью… Мы очень сильно недорабатываем с данными, которые есть, не вынимаем оттуда все, что можно было бы использовать». И связано это прежде всего с тем, что много данных получить уже не проблема, а специалистов, способных с этими данными работать крайне мало.
В Калининградской области вузы осуществляют подготовку специалистов по наукам о человеке., в том числе по биоинформатике, однако среди студентов и молодых ученых в данной области существует потребность в развитии профессионального сообщества вне стен вуза, а также в более углубленном практическом обучении со специалистами-биоинформатиками-практиками. И с целью формирования у молодых исследователей, ученых, студентов и школьников дополнительных компетенций в области анализа больших био-данных будет осуществлен проект Летняя школа Биоинформатики для школьников, студентов, молодых ученых.
Проект инициирован сообществом молодых ученых Балтийского федерального университета им.И.Канта и поддержан Ассоциацией учителей и преподавателей биологии региона.
Научная школа даст возможность для накопления опыта в области биоинформатики молодым ученым Калининградской области, а также активизации обмена опытом между поколениями биоинформатиков. Молодые ученые, погрузившись в профессиональные вопросы биоинформатики смогут помогать совсем молодым — студентам, которые только вступают на этот путь.
В основу обучения в научной школе лягут прикладные исследования под руководством специалистов в области биоинформатики, вычислительной биотехнологии, возможность пробовать себя в самых передовых технологических областях, экспериментировать, а также получить углубленные знания и опыт работы над реальными задачами.
Миссия проекта – активизация интереса молодых ученых, а также старшеклассников, студентов, аспирантов, молодых специалистов к направлениям научно-инженерной деятельности в области биоинформатики и вычислительной биологии, формирование профессионального сообщества.
Школа будет проведена на русском языке.
В течение 5 учебных дней в научной школе участники будут осваивать технологии биоинформатики и вычислительной биологии, научатся применять языки программирования для решения исследовательских задач, строить пайплайны, визуализировать результаты, обрабатывать данные NGS и прочим навыкам, смогут стать частью профессионального сообщества.
Участие в школе бесплатное.
Реализация проекта совместно с Балтийским федеральным университетом им.И.Канта и Ассоциацией учителей и преподавателей биологии региона позволит использовать современное оборудование исследовательских лабораторий, привлечь в качестве лекторов и наставников школы ведущих специалистов в области биоинформатики и вычислительной биологии и реализовать проект с максимальной эффективностью.

География проекта

Калининградская область

Целевые группы

1. школьники старших классов
2. студенты
3. молодые ученые-биологи
4. молодые ученые-информатики
5. аспиранты