Проекты

Краткое описание

Цель проекта — Выявление, поддержка, продвижение и объединение молодых ученых и специалистов в области биоинформатики для поиска уникальных инновационных решений на актуальные задачи, стоящие перед современной медициной и наукой. Проект стремится создать междисциплинарное сообщество, объединяя ученых, врачей, инженеров, представителей бизнеса и технологических компаний для разработки и внедрения передовых технологий и методов, таких как ИИ, геномика, персонализированная медицина и фармакология. Стимулируем профессиональный и карьерный рост участников через образовательные программы, менторскую поддержку и продвижение успешных инициатив, способствующих развитию науки и здравоохранения в России.
В рамках биохакатона будут решаться задачи по 5 направлениям, каждая из которых имеет важное значение для медицины и биоинформатики (подробнее п.8):
1.Анализ публичности иммунного ответа в зависимости от возраста и других характеристик пациентов; 2. Предсказание mhc-контекста по репертуару; 3. Идентификация диплоидных опухолевых клеток в данных; 4. Выявление бактериальных и вирусных транскриптов в данных полноразмерного single-cell RNA-seq технологии SeekGene scFAST-seq; 5. Выявление генных регуляторных сетей в ходе спецификации кожных покровов млекопитающих на ранних стадиях эмбриогенеза.
Механика реализации проекта:
1.Всероссийский отбор молодых ученых в сфере биоинформатики и специалистов врачебной практики (Генетики, биологи), не менее 1000 уч.
2.Выявление лучших кандидатов экспертным сообществом проекта (докторами и кандидатами медицинских наук, авторами передовых технологий международных институтов и лабораторий, направляющих мировое научное развитие в практике) из числа менторов, экспертов, специалистов врачебной практики и ученых в сфере биоинформатики (Генетики, биологи, онкологи, фармакологи) не менее 15 экспертов. Финалистами станут не менее 40 уч.
3.Организация и проведение Биохакатона «На здоровье» в г. Санкт-Петербург, при поддержке не менее 10 партнеров. Включет представителей фармакологического бизнеса и представителей научных институтов, научно- исследовательских лабораторий. Длительность мероприятия не менее 5 дней.
4.Дальнейшее продвижение лучших решений уч. проекта и организация взаимодействия с представителями фармакологического бизнеса, научными институтами и исследовательскими лабораториями.
5.Информационное сопровождение проекта, включая публикацию контента, онлайн-трансляцию и просветительскую программу с уникальной информацией о биоинформатике, медицине будущего и инновационных технологиях охватит не менее 5 000 уч. Что будет способствовать повышению уровня знаний о современных подходах в здравоохранении и укреплению интереса к науке и биомедицинским исследованиям. Информационная кампания также привлечет внимание к важным вопросам здоровья и медицины, что создаст положительное восприятие биоинформатики в обществе.
Опираясь на многолетний опыт реализации проектов, поддержку отраслевых партнеров, мы гарантируем достижение показателей

Цель

1. Выявление, поддержка, продвижение и объединение молодых ученых и специалистов в области биоинформатики для поиска уникальных инновационных решений на актуальные задачи, стоящие перед современной медициной и наукой.

Задачи

1. Поиск молодых ученых в области биоинформатики
2. Организация и проведение Биохакатона в г. Санкт-Петербург
3. Информационная кампания
4. Организация продвижения лучших решений
5. Подведение итогов проекта

Обоснование социальной значимости

Проблема, с которой сталкиваются молодые ученые, исследовательские институты и бизнес в области биоинформатики и медицины, заключается в отсутствии налаженной коммуникации и взаимодействия между ними для совместного поиска инновационных решений. Современная наука и медицина требуют не только глубокой специализации, но и междисциплинарного подхода, где молодые ученые могут работать с представителями бизнеса и научных организаций для внедрения передовых технологий в практическую медицину. Биохакатон «На здоровье» направлен на решение этой проблемы, предоставляя площадку для совместной работы и обмена знаниями, что в конечном итоге способствует улучшению здоровья людей и развитию инноваций.

В рамках биохакатона будут решаться задачи по пяти направлениям, каждая из которых имеет важное значение для медицины и биоинформатики:
1. Анализ публичности иммунного ответа в зависимости от возраста и других характеристик пациентов.
Иммунный ответ — ключевой механизм защиты организма от инфекций и заболеваний, но его эффективность меняется с возрастом, а также зависит от множества факторов, таких как пол, генетика и сопутствующие заболевания. Анализ данных по иммунному ответу помогает выявить закономерности, которые можно использовать для улучшения лечения различных групп пациентов. Эта задача важна для разработки персонализированных методов лечения и профилактики заболеваний, таких как COVID-19, рак и аутоиммунные заболевания.
2. Предсказание MHC-контекста по репертуару.
MHC (Major Histocompatibility Complex) играет важную роль в иммунной системе, представляя антигены для Т-клеток, которые затем активируются для борьбы с инфекцией или опухолью. Предсказание MHC-контекста на основе репертуара Т-клеток поможет точнее прогнозировать, как иммунная система каждого конкретного пациента будет реагировать на определенные антигены. Это направление особенно важно для разработки новых вакцин и иммунотерапий, поскольку правильное понимание MHC-контекста может значительно повысить эффективность лечения.
3. Идентификация диплоидных опухолевых клеток в данных.
Опухолевые клетки часто обладают генетической нестабильностью, что приводит к аномальным процессам деления и росту. Однако в опухолях могут быть диплоидные клетки, сохраняющие нормальный набор хромосом. Идентификация этих клеток позволяет лучше понять механизмы развития опухолей и их поведения. Эта задача важна для разработки новых подходов к лечению рака, так как она позволяет более точно нацеливать терапию и прогнозировать эффективность лечения.
4. Выявление бактериальных и вирусных транскриптов в данных полноразмерного single-cell RNA-seq технологии SeekGene scFAST-seq.
Технология single-cell RNA-seq позволяет анализировать транскриптомные данные на уровне отдельных клеток, что особенно полезно для выявления скрытых инфекций или бактериальных и вирусных компонентов, которые могут присутствовать в тканях. Это направление важно для понимания микробиома человека, а также для обнаружения скрытых инфекций, которые могут влиять на развитие заболеваний, таких как рак или хронические воспалительные процессы. Выявление транскриптов на уровне отдельных клеток также помогает улучшить диагностику и разработку терапий.
5. Выявление генных регуляторных сетей в ходе спецификации кожных покровов млекопитающих на ранних стадиях эмбриогенеза.
Развитие кожи — сложный процесс, регулируемый множеством генов и сигналов на ранних стадиях эмбриогенеза. Понимание того, как регулируются эти сети, может помочь в разработке методов лечения врожденных дефектов, а также в создании новых подходов к регенеративной медицине. Это направление важно для разработки терапий, направленных на восстановление поврежденных тканей, и для лечения заболеваний, связанных с аномалиями кожных покровов.

Проект «Биохакатон «На здоровье» — вектор в будущее» объединит ученых, врачей, биологов и представителей бизнеса для совместного решения ключевых задач по данным направлениям, что в итоге приведет к значительным достижениям в медицине и улучшению здоровья людей.

География проекта

Представители целевых групп, с которыми запланировано взаимодействие в рамках мероприятий проекта, находятся во всех регионах Российской Федерации. Ключевое мероприятие проекта состоится в городе Санкт-Петербург. Для обеспечения максимальной вовлеченности участников и доступности мероприятий планируются дистанционные форматы, включая онлайн-трансляции на интерактивные платформы.

Целевые группы

1. Молодые ученые в сфере биоинформатики и специалисты врачебной практики. Генетики, биологи.
2. Менторы, эксперты, специалисты врачебной практики и ученые в сфере биоинформатики. Генетики, биологи, онкологи, фармакологи.
3. Молодые ученые и врачи, которые хотят использовать инновационные достижения и работу с ИИ.
4. Представители фармакологического бизнеса и представители научных институтов, научно- исследовательских лабораторий.